Sejarah berdiri dan tumbuhkembang Fakultas Peternakan Universitas Jambi (FAPET-UNJA) tidak terlepas dari perjalanan sejarah Universitas Jambi. Cikal bakal Universitas Jambi dimulai dengan pendirian Yayasan Perguruan Tinggi Jambi yang diprakarsai oleh Gubernur Jambi, M. Joesoef Singedekane, Pemerintah Kota Besar Jambi yang dipimpin oleh Walikota Raden Soedarsono dan tokoh-tokoh masyarakat Jambi. Yayasan Perguruan Tinggi Jambi kemudian mendirikan Akademi Perniagaan Jambi pada 29 September 1960. Akademi Perniagaan Jambi kemudian berubah menjadi Fakultas Ekonomi bersamaan dengan pendirian Fakultas Hukum pada tahun 1961.
Berbekal dua fakultas yang ada yaitu Fakultas Ekonomi dan Fakultas Hukum pada tahun 1963 berhasil didirikan universitas dengan nama Universitas Negeri Jambi yang dikukuhkan dengan Surat Keputusan Menteri Perguruan Tinggi dan Ilmu Pengetahuan (PTIP) Nomor 25 Tahun 1963 Tanggal 23 Maret 1963. Sejalan dengan terbitnya Surat Keputusan itu, dibentuk dua fakultas baru yaitu Fakultas Pertanian dan Fakultas Peternakan yang diresmikan pada tanggal 1 April 1963. Mulai saat itu, tanggal 1 April dijadikan Hari Ulang Tahun (Dies Natalis) Universitas Jambi.
Drh. Tjetje Argawa yang lulus dari Fakultas Peternakan Hewan Institut Pertanian Bogor (waktu itu masih Universitas Indonesia) merupakan Dekan Fakultas Peternakan pertama (1963-1965). Drh. Tjetje Argawa saat menjabat sebagai Dekan Fakultas Peternakan, beliau memangku jabatan sebagai Kepala Dinas Peternakan Provinsi Jambi. Pada waktu itu (1963) dosen Fakultas Peternakan hanya beliau seorang dan sekretaris Dekan dijabat rangkap. Kemudian datang 3 orang dosen tetap lulusan IPB yaitu drh. Soebandrio, drh. Kadarman dan drh. Md. Toha yang kemudian diangkat sebagai Pembantu Dekan. Tahun 1965, beliau digantikan oleh Drh. Md. Toha sebagai Pejabat Dekan sementara karena drh. Tjetje Argawa pindah ke Jakarta. Setahun kemudian (1966), drh. MD. Toha digantikan oleh drh. Kadarman yang memimpin selama 8 periode (1966-2000) yang interval satu periode (1992-1996) oleh Ir. Hanafi Nur, M.S.
Saat ini, FAPET-UNJA berkembang dengan menyelenggarakan 5 program studi (SK Rektor Nomor 564/UN21/OT/2021). Penambahan program studi diperoleh melalui penugasan penyelenggaraan program studi baru yaitu program studi DIII Kesehatan Hewan, program studi DIII Teknologi Hasil Perikanan (Surat Penugasan Nomor 85/E.E2/DT/2014) dan Program Studi Pemanfaatan Sumberdaya Perikanan (Surat Penugasan Nomor 1598/E/T/2012) sedangkan Program Studi Magister Ilmu Peternakan melalui reposisi program studi monodisiplin (SK Rektor Nomor 1734/UN21/OT/2020).